空间转录组学这个术语用英语咋说

1、空间转录组学这个术语用英语咋说

Spatial transcriptomics

2、空间转录组学这个术语用英语咋说呢

Spatial transcriptomics

3、nanostring空间转录组

纳米弦空间转录组是一种高通量技术，用于测量特定组织或细胞类型中不同组织区域的基因表达模式。它允许研究人员了解基因表达如何在空间上呈模式化，并且在发育、疾病和治疗反应方面具有重要的应用。

纳米弦空间转录组基于纳米弦技术，该技术使用荧光标记的短核酸探针来检测特定基因的转录物。在空间转录组中，组织切片被放置在具有网格结构的玻璃载玻片上。每个网格孔代表组织中的特定区域。组织被固定并致密化，然后使用荧光成像显微镜对载玻片进行成像。

纳米弦探针与组织中的转录物杂交，产生荧光信号。通过成像，可以测量每个网格孔中的基因表达模式。每个孔的mRNA表达数据代表了该组织区域的基因表达特征。

纳米弦空间转录组已被用于各种应用，包括：

组织发育：了解不同组织区域中基因表达的时空动态。

疾病机制：识别疾病状态下基因表达模式的变化。

治疗反应：评估对治疗干预的异质性反应。

药物开发：确定药物靶标在特定组织区域中的表达模式。

生物标志物发现：识别与特定组织区域相关的基因签名。

纳米弦空间转录组相对于传统转录组分析方法具有以下优势：

空间分辨率：提供特定组织区域的基因表达信息。

高通量：一次可以测量多个基因的表达。

灵敏：可以检测低丰度转录物。

多路复用：允许同时检测多个荧光标记。

定量：提供基因表达水平的定量数据。

组织渗透：探针的组织渗透有限，限制了在某些组织中的应用。

样品准备：组织准备过程可能具有挑战性，影响数据质量。

成本：纳米弦空间转录组技术相对昂贵。

4、空间转录组技术方法的比较

空间转录组技术方法的比较

空间转录组技术是一种用于研究基因表达在组织或器官特定位置的分布的技术。它们使研究人员能够了解不同细胞类型之间的基因表达异质性，以及它们在空间上是如何组织的。

以下是一些常见的空间转录组技术及其比较：

| 技术 | 原理 | 分辨率 | 样品类型 | 优点 | 缺点 |

| 原位杂交 (ISH) | 使用标记探针检测特定基因的表达 | ~10 μm | 原位组织切片 | 单细胞分辨率，组织形态保留 | 仅检测有限数量的基因 |

| FISH (荧光原位杂交) | 使用荧光探针检测染色体或基因组区域 | ~100 kb | 固定细胞或组织切片 | 高特异性，可同时检测多个靶点 | 低通量，难以成像大样本 |

| 单细胞测序 | 将单个细胞捕获并对其进行 RNA 测序 | ~100 nm | 细胞悬液 | 高通量，可检测所有表达基因 | 样品制备复杂，丢失组织形态信息 |

| 空间转录组条码技术 | 在组织上创建条码，并捕获特定位置 RNA | ~10100 μm | 组织切片 | 中等通量，保留组织形态信息 | 分辨率较低，需要额外的步骤 |

| 体素显微镜 | 使用三维成像技术绘制基因表达图谱 | ~1 μm | 清除组织 | 高分辨率，保留组织形态信息 | 成像时间长，成本高 |

| 多重组织成像 (mROI) | 使用免疫荧光在多个位置检测蛋白质表达 | ~1 μm | 组织切片 | 高通量，保留组织形态信息 | 检测范围有限，需要抗体 |

| 大规模单细胞核 RNA 测序 | 分离细胞核并对 RNA 进行测序，同时保留空间信息 | ~110 μm | 组织切片 | 高通量，保留部分空间信息 | 分辨率较差，分离细胞核可能造成损伤 |

选择方法时的考虑因素：

所需分辨率：所需空间分辨率将指导技术选择。

样品类型：不同的技术适用于不同的样品类型（组织切片、细胞悬液等）。

通量：所需通量将影响成本和时间考虑因素。

样品处理：某些技术需要额外的样品处理步骤，例如组织清透或细胞核分离。

成本：不同技术之间的成本差异很大。

通过考虑这些因素，研究人员可以选择最适合其研究目标和预算的空间转录组技术。